我们都知道20种氨基酸由氨基(–NH)、羧基(–COOH)、α-碳原子和侧链(R基)组成。其中真正让20种标准氨基酸彼此不同的,就只有这个侧链。侧链虽然只是挂在α碳上的一个小基团,但是侧链决定了氨基酸的性质,翻译后修饰的靶点,酶的活性中心,蛋白的折叠方式……可以说,没有侧链,就没有蛋白质的多样性。20种氨基酸能组合出无数种蛋白质以及多肽,靠的就是这20种侧链排列组合。

图片1-氨基酸-多肽-蛋白.jpg

以下浅谈几类特殊侧链造就的不同氨基酸及其化学反应性质。

一,20种标准氨基酸中有一个个性的氨基酸,没有任何侧链:甘氨酸

甘氨酸没有侧链,其α-碳上连接两个氢原子,因此不具有手性,且其衍生物比其他氨基酸的衍生物更具反应性,甚至能在α-碳原子上发生反应,这种高反应性源于其结构上的最小空间位阻。

二,侧链疏水的氨基酸反应特性

甘氨酸(Gly),丙氨酸(Ala),缬氨酸(Val),亮氨酸(Leu),异亮氨酸(Ile),甲硫氨酸(Met),脯氨酸(Pro),苯丙氨酸(Phe) 均具有疏水侧链。这些疏水氨基酸中,缬氨酸和异亮氨酸的侧链β-碳原子上均带有甲基取代基,造成显著的空间位阻,从而降低了它们的化学反应性,在实际合成生产中也会降低纯品的收率。

三,合成反应中易氧化氨基酸

在20种标准氨基酸中,真正容易被氧化的核心成员只有4个:半胱氨酸(Cys)、甲硫氨酸(Met)、色氨酸(Trp)、酪氨酸(Tyr)。组氨酸(His)和苯丙氨酸(Phe)在特定条件下也会氧化,但活性弱得多。相反,丝氨酸和苏氨酸的醇羟基对氧化不敏感。

图片2-氨基酸结构.png

四,侧链亲水氨基酸的共同反应底色

亲水氨基酸(极性不带电+带正电+带负电)——它们的核心标签不是"躲水",而是亲水、能形成氢键、很多能电离、能参与共价反应和翻译后修饰。亲水氨基酸通常包括 Ser、Thr、Cys、Tyr、Asn、Gln(极性不带电) + Lys、Arg、His(碱性带电) + Asp、Glu(酸性带电)。不管具体基团是什么,亲水氨基酸在化学反应上有几个共性:1,能和水/极性环境形成氢键;2,侧链含 O/N/S 极性原子;3带电侧链(Asp/Glu/Lys/Arg/His)参与盐桥、静电结合、pH 依赖的酸碱反应。

五,其他特殊侧链的氨基酸反应说明

脯氨酸的丙基侧链与其氨基相连,形成刚性的吡咯烷环,因此脯氨酸属于亚氨基酸。脯氨酸的环状结构可防止其在羧基参与反应时发生异构化。

苏氨酸和异亮氨酸各自含有两个不对称碳原子,因此具有多个立体异构体。

半胱氨酸侧链-SH,两个半胱氨酸的–SH氧化形成二硫键(–S–S–),是分泌蛋白和胞外蛋白的结构骨架。

        以上是针对20种标准氨基酸的侧链简单说明, 20种氨基酸,20种侧链,侧链虽小,却决定了氨基酸的一切差异,进而决定了蛋白质的结构、功能、相互作用和调控方式。排列组合出地球上数以亿计的不同蛋白质——这就是生命化学的精妙之处。

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